然而正当明辽东总镇巡抚：王化贞，在闭门处理军务书籍时，他却不知广宁卫城中有变？只有明大凌河左参将：江朝栋，孤身闯入辽东总镇巡抚衙门，在推门而入时还被明辽东总镇巡抚给大声训斥，但明大凌河左参将也顾不得太多了，他直接大喊道“王总镇巡抚大人不好了！外面有许多逃兵，杀入城了，事情危险请迅速撤离！”
说罢还没等明辽东总镇巡抚作出反应，便搀扶着他出门上马，与部分将领一起丢弃广宁卫仓皇逃走。不巧来到大凌河边时，正巧与自己的上司明辽东总镇经略：熊廷弼，相遇还被明辽东总镇经略给嘲笑道“王总镇巡抚大人好厉害啊！区区6万军队就可以把敌人一举歼灭，现在怎样呢？”
自知感到惭愧的明辽东总镇巡抚，就建议他应当驻守宁远卫或者广宁前屯卫。但明辽东总镇经略却说道“已经晚了！现如今只有保护军民们尽早往南，最好是撤入山海卫去，而你我两人犯下这丢失城池之罪，还是早日入关上奏陛下，请求赎罪吧！”
说完就把5千士兵交给明辽东总镇巡抚殿后，并把全部积蓄烧了准备马上撤军，由明辽东总镇经略和明宁远卫指挥佥事：韩初命，一起护送难民们入关。随后明辽东总镇巡抚：王化贞、明辽东总镇监军道：高出、明兵科给事中：胡嘉栋，等将领也先后入关，眼下趁着广宁卫城中无主帅统领，故此明广宁卫游击将军：孙得功，就开始写书信联络后金三等总兵：李永芳，让他通知城里内应准备叛变。此刻明松山堡总兵：高邦佐，虽然已蒙朝廷批准本可离职，所以左右劝其趁早入关避难。但明松山堡总兵却大骂道“本协若一日不走，就一日都是封疆大臣，岂能坐视国破山河碎，百姓流离失所？”
因此安顿好家人好不愿离开，还写信给明辽东总镇经略让他坐镇广宁卫安抚民心，写道“城中虽乱，但敌情尚未可知，可即刻提兵入城镇抚，人心自定，请授兵于我赴难。”
怎奈熊总镇经略已经去到宁远卫了，留下明松山堡总兵始终不愿意离去，只得仰天长叹，他决定坚守松山堡与广宁中屯守御千户所。当然愿意继续留下来坚守阵地的，还远不止他一个人，还有明广宁卫副总兵：刘佂、明义州卫指挥使：麻承宗、明广宁中屯卫都司：陈尚仁、明广宁右卫都司：王崇信、明广宁后屯卫游击将军：刘式章，等将领依旧固守城池。正月26日，明广宁卫游击将军：孙得功，首先率领广宁卫的叛变明军与内应悄悄打开城门，让后金三等总兵：李永芳，带领下的军队入城控制局势。故此由明广宁卫副总兵：刘征，带领下开始与叛军以及敌军展开巷战，可由于分不清楚那个是忠明的士兵？那个是亲后金的士兵？因此在巷战中被误杀阵亡！紧接着广宁中卫、广宁左卫、广宁右卫，也相继发生暴乱，明广宁右卫都司：王崇信，在抵抗后金军时不幸阵亡！随之而来的就是明义州卫指挥使：麻承宗、明广宁后屯卫游击将军：刘式章，两支明军正在北上支援广宁卫途中，遇到了漠南蒙古察哈尔部1万多骑兵。这支漠南蒙古察哈尔部骑兵原来是被漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗：孛儿只斤·林丹汗巴图尔（虎墩兔）派来救援广宁卫明军的，还有2万军队因雪阻未至，可眼下得知广宁卫失陷，后金方面正在掠夺物资，在去救援广宁卫意义不大！因此漠南蒙古察哈尔部军队转而去守山海卫、广宁前屯卫、宁远卫，等地，并继续与大明约定夺回广宁卫后的赏赐，大明为了安抚漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗的花费预计多达百万两白银。另外又有漠南蒙古内喀尔喀五部的骑兵，以及漠南蒙古喀喇沁部（哈喇慎部）、漠南蒙古科尔沁部，等漠南蒙古诸部趁机南下，等漠南蒙古察哈尔部1万多骑兵刚撤，漠南蒙古内喀尔喀五部骑兵与其余漠南蒙古军队就开始攻打明军阵营。不一会儿就冲破明军火炮营又突击火铳队，从而歼灭这支明军，致使明义州卫指挥使：麻承宗、明广宁后屯卫游击将军：刘式章，等明军将领相继阵亡！最后就是坚守在广宁中屯卫的明军了，而广宁左屯卫仅有少数明军驻守，在得知有大批漠南蒙古联军南下时，明军出阵迎敌败下阵来，明广宁中屯卫都司：陈尚仁，坚守到最后一刻城破殉国！漠南蒙古联军本打算继续南下，又遇到后金军来袭广宁中屯守御千户所与松山堡，明松山堡总兵：高邦佐，与投降后金的叛徒后金镶白旗中军游击将军：孙得功，交战阵亡。之后漠南蒙古联军与后金军又继续南下到达，宁远中左守御千户所杏山堡劫掠，后金军追赶他们熊总镇经略与王总镇巡抚追了二百里，因路上没得粮食吃才回去。但却不敢继续南下了，一是碍于明军南部的防御，以及后金方面也在争抢物资，便放弃进军，毕竟在走下去可就是明军防御重地〈宁远卫〉了。至此从宁远中左守御千户所一直到三岔河地区的大片土地全部丢失，陷入被漠南蒙古诸部瓜分以及后金的占领当中，其卫所城堡关卡等丢失土地有；广宁卫、广宁中卫、广宁左卫、广宁右卫、广宁前卫、广宁后卫、广宁后屯卫、广宁中屯卫、广宁左屯卫、广宁右屯卫、广宁中左守御千户所，义州卫、宁远中左守御千户所、西宁堡、吴家坟、沙岭驿、平洋桥堡、西平堡、东莲子湖、镇武堡、西兴堡、付家庄台、杜家屯、盘山驿、镇宁堡、中安堡、镇远堡、镇安堡、镇靖堡、镇边堡、正安堡、魏家岭关、白土厂关、三塔谷、双山台、花儿营、镇夷堡、牵马岭驿、闾阳驿、十三山驿、大清堡、东海堡、瓦子谷、大靖堡、太平堡、狗河寨、万佛堂、大康堡、大定堡、团山堡、开州屯、大凌河堡、小凌河驿、大茂堡、流水堡、大胜堡、松山堡、杏山驿、塔山堡、大福堡、大兴堡、椵木冲堡。其中后金覆育英明天命汗：爱新觉罗·努尔哈赤，在后金八旗军进驻广宁卫时派人查阅，所占领麾下的辽河以西幸存居民，全部驱到了辽河以东，并让辽河军民们全部（剃发易服）不从者一律屠杀。并且由此次的大功臣后金镶白旗中军游击将军：孙得功，带领长子：孙有光、次子：孙思克，一起前来恭迎后金大汗入城。面对如此优秀的战绩，一下子得到这么多土地，实在是让后金覆育英明天命汗惊讶不已！这与之前（沈辽会战）得到的大片辽南四卫土地一样，感觉不可思议，但马上探哨的汇报便让他陷入到沉思当中，因为与后金同时出兵争夺土地以及物资的还有漠南蒙古各部，因此得到的土地并非全部在后金控制之下。再加上漠南蒙古诸部有部分还在，漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗的统领中，因此后金覆育英明天命汗对这个问题非常棘手，打算先与漠南蒙古诸部交涉。次日辰时，睡了一觉醒来的明潼关卫千总：吴俊振，在整理了一下思路后，又继续跑去询问明潼关卫把总：马维，问道“哎！马兄昨日你说到那个什么丢失广宁卫之后，那接下来我大明，又是如何抵抗东虏建奴的呢？”
只见马维坐下了喝了一杯茶后，又让店小二上了几碟菜，才一边吃一边继续说下去……。战败的消息很快就传到了朝廷，京城上下均为之震惊，明兵部尚书：张鹤鸣，有些害怕了，他连忙进京上奏朝廷，又自请前往辽东都指挥使司察看军队，还推举自己为「辽东总镇经略」被明熹宗：朱由校，封为［太子太保］官衔，又赐蟒袍玉带及尚方宝剑出师宁远卫坐镇。朝廷当即下令派出北镇抚司锦衣卫缇骑，前去山海卫逮捕王化贞，又罢免了熊廷弼的辽东总镇经略官职，让他听候审问。正月29日，明熹宗传谕兵部加强戒备，又让其亲军二十六卫之一的北镇抚司锦衣卫、东厂锦衣卫，分别严缉京城间谍，并且下令禁止居民燃放鞭炮，以此断绝传递消息。2月初3日，明水西宣抚使司同知：安邦彦，率军2万人借口朝廷征兵支援辽东都指挥使司为由，发动袭击并在刚刚叛变的明乌撒军民府知府：安效良，以及乌撒卫驻军的协助下，攻占毕节卫拿下七星关守御后千户所。致使云南承宣布政使司乌撒后守御千户所治下的明沾益州知州夫人：设科，也纠集明乌撒后守御千户：普胙，等人起兵作乱。当然作为与四川承宣布政使司东川军民府、乌撒后守御千户所沾益州有姻亲关系的云南承宣布政使司武定军民府知府：张世臣，便与明沾益州知州夫人遥相呼应。叛军乌撒军民府知府：安效良，也一同南下兵援贼兵，致使云南承宣布政使司曲靖军民府全境沦陷，而寻甸府也岌岌可危！其表现出的凶悍就不难理解了。就连贵州承宣布政使司贵阳府洪边州等地土官也纷纷响应造反。三路叛军们先后分兵进攻贵州宣慰使司都司府（贵阳府）贵州卫、贵州前卫、安顺军民府、毕节卫、平坝卫、龙里军民卫、平越军民卫、平越军民府、镇远府偏桥卫、普安州、安南卫、思州府、兴隆卫、都均军民府、都均军民卫、威清卫、镇康州、云南承宣布政使司曲靖府沾益州，湖广承宣布政使司辰州府沅州，等地，彻底切断了明军救援路线以及滇黔通路。