第二天，庾亮晋见皇帝，又顿首至地，并请求辞官回家。帝不允许，派遣尚书侍中持手诏安慰庾亮：“这是社稷之灾，国家之难，并非舅舅的过错。”
随后杀叛臣西阳王司马漾并其二子及彭城王司马雄。任让原来跟王导关系不错，王导建议宽恕任让。成帝说：“就是先前杀我右卫刘超和侍中钟雅的那个小子吗？绝对不能饶恕！”
于是当即将他处死。叛军将领张健、韩晃、马雄等人也被郗鉴军诛杀。至此，苏峻、祖约叛乱全部平定。公元329年（咸和四年），苏峻之乱平息后，宫廷宗庙都被焚为灰烬。温峤建议迁都到豫章（南昌），东吴之地的豪杰们请求定都于会稽（绍兴），这两种意见争来争去，谁也说服不了谁，朝廷不知怎么办为好。后来，还是由王导最后一锤定音。王导说：“建康，即古时的金陵，过去就是帝王之都，而孙仲谋、刘玄德都说这里是帝王之宅。古代帝王不必因简陋豪华而移都，如果能弘扬卫文公以大布之衣、大帛之冠为君的风尚，则可无事不成。若不勤勉耽于安乐，即使找到一块乐土，也会变成废墟。况且北方敌寇像游魂一样，窥伺我们的空隙，我们一旦有胆怯的表现，跑到南越之地，再想得到威望和实力，恐怕是难以办到的。现在应该特别镇静，这样民情便可自安了。”
由此温峤等人的迁都计划未能实施。咸和四年（329）三月，苏峻、祖约之乱平定后，大赏群臣。陶侃因功大为侍中、太尉、封长沙郡公；郗鉴为侍中、司空、南昌县公；温峤为骠骑将军、开府议同三司，加散骑常侍、始安郡公；陆晔进爵江陵公；封毛宝为州陵县开国侯，食邑一千六百户。其余赐爵侯、伯、子、男者甚多。卞壸、桓彝、刘超、钟雅等死难者均加赠恤。陶侃移镇巴陵（今湖北岳阳），温峤还镇武昌（今湖北鄂城）。庾亮再与成帝相见，伏地谢罪，再三请求归隐江湖。在得不到批准的情况下，请求去地方镇守效力。于是出任豫州刺史，领宣城内史，镇守芜湖。与此同时，参与苏峻叛乱的路永、匡术、贾宁等人因中途背叛苏峻投降朝廷，赦免其罪不治。王导还想奖赏决战前投奔朝廷的路永、匡术等人，欲给他们加官。温峤说：“他们是苏峻集团叛乱的主犯之一，只因为他们最后投诚了，才饶他们不死。他们犯了如此大罪，没有要了他们的狗命，已经够便宜他们的了，哪里还能再让他们继续担任官职呢？”
在温峤的坚决反对下，王导只得做罢。湘州刺史卞敦在苏峻叛乱时期首鼠两端，既不讨逆，也不主动供给讨伐军所需粮草。此时受到朝廷冷落。不久便忧愧抑郁而亡。灵隐寺始建于东晋咸和元年（公元326年），至今已有约一千七百年的历史，为杭州最早的名刹，也是中国佛教禅宗十大古刹之一。地处杭州西湖以西灵隐山麓，背靠北高峰，面朝飞来峰，两峰挟峙，林木耸秀，深山古寺，云烟万状。开山祖师为西印度僧人慧理和尚，他在东晋咸和初，由中原云游至武林（即今杭州），见有一峰而叹曰：“此乃中天竺国灵鹫山一小岭，不知何代飞来？佛在世日，多为仙灵所隐”，遂于峰前建寺，取名叫“灵隐寺”。可惜灵隐寺刚建成不久，就发生了苏峻叛乱，慧理修建的佛塔佛寺未能幸免，被焚之一炬。苏峻之乱平息后。来此地云游的高僧佛图澄，提议重建灵隐寺。都乡侯、散骑常侍何充非常敬重佛法，所以很高兴主持重新修造。何充（292年－346年），字次道，庐江郡灊县（今属安徽霍山）人。晋朝重臣。官至中书监、骠骑将军、录尚书事，封都乡侯。后来在晋康帝和晋穆帝时辅政。何充风度气韵儒雅，才学渊博，能写文章，酒量也很好，尤其是喝酒时的风度气质让人折服。当时的名士、丹阳尹刘惔(dan)曾经说：“看到何次道饮酒，就令人想把家中珍酿全都拿给他。”
何充是王导妻子的姨甥，而何充妻子是庾文君之妹，因此何充与晋明帝、王导都友好，很早就担任显要官位。一次何充去见王导，王导以尘拂指着坐床叫何充和他同坐，说：“这里是你的坐位。”
甚至王导修缮扬州官舍时也向何充说：“修造这里的衙门，正是为了你何次道啊。”
可见王导与何充的友好和亲近。何充正直敢言。当初担任王敦主簿时，听到王敦在公众场合自卖自夸、为其兄长王含“护短”说道：“家兄在庐江做官的官声、政绩都一定很不错，庐江人士上上下下没有不称赞的。”
但当时身为庐江太守的王含在当地贪污，名声很臭。何充当即直言反驳：“我就是庐江人，所听到的根本就不是这么回事。”
王敦听后沉默不语。在场众人既佩服何充的耿直和胆量，又深深地为何充感到不安，但何充神情自若。因此何充被王敦贬为东海王文学。太宁二年（324年）王敦之乱平定后，何充被朝廷任命为中书侍郎。何充喜欢佛典，热衷于修造佛寺，任东阳、会稽地方官时，平时供养沙门超过一百人，花费过亿，但却对亲友未加照料。他的亲戚朋友有的非常贫穷，他也不管不顾。因而引来时人非议。太宁三年（325年），晋成帝即位后，任命何充为给事黄门侍郎。咸和三年（328年），历阳内史苏峻领兵攻陷建康后，何充东奔三吴地区加入王舒、虞潭等人的讨伐军抗击苏峻。次年，苏峻之乱被平定，何充被封为都乡侯、散骑常侍。平南军司、散骑常侍、丰城子刘胤，从来就不信奉佛法，傲慢三宝(括佛宝、僧宝、法宝）他来到新建成的灵隐寺，对何充说：“听说这次灵隐塔的修建还邀请了中原的得道高僧前来指导了，是真的吗？”
何充说：“这事儿千真万确。是得道高僧佛图澄前来主持的开光仪式。他还就近去了附近几个风景名胜之地主持修建了寺庙，比较有名的就有太湖佛图寺、潜山太平寺、宿松忠节寺等等。”
刘胤说道：“都说中原的高僧佛图澄佛学深厚，道行高深莫测，可是看看眼前的这座佛寺也没什么特别之处啊？哦，我早就听说此塔屡放光明，总认为这简直是荒诞不经，所以我从来不信。除非让我亲眼看见，才能相信。”
刘胤话刚说完，佛塔上立即放射出五彩光芒，照耀佛寺。刘胤惊得毛发倒竖，肃然起敬，赶紧伏地叩头，口称“死罪！死罪！”
从此刘胤信奉佛法，并在刘胤的资助下，在灵隐寺寺院的东边，又立了一座小塔。此后没几天，刘胤便接到朝廷诏令。圣旨说：“由于温峤病故，令刘胤代替温峤担任平南将军、都督江州诸军事、领江州刺史、假节。即日赴任。”
“哈哈，升官了！当大官了！哈哈哈……”朝廷的任命把刘胤乐得屁颠屁颠的。天知道这次刘胤的升迁是福是祸。那温峤又是怎么突然之间就病故了呢？原来，温峤在苏峻之乱平定后，拒绝了朝廷上下让他留在朝中辅政的要求。温峤认为王导是先帝所任命的人选，于是要求返回江州。此时的京师方经战乱，残破不堪，物资缺乏，温峤给自己家里留下一些生活必需品，将全部家当都献给了朝廷，然后返回武昌。329年四月，温峤路过牛渚矶，见水深不可测，听很多人说这里水下有很多怪物，温峤也多次听到过类似的传说。温峤便命人点燃犀牛角下水去照看。看见水下灯火通明，水怪奇形怪状，往来穿梭，形形色色，有乘马车的也有穿红衣服的。不料温峤到了武昌。当夜，温峤梦到一个人愤怒地对他说“我和你幽明有别，各不相扰，为什么要来照我们呢？”
梦醒之后，温峤发现自己浑身像散了架一样，半边身子和手脚都不听使唤。口眼歪斜，说话嘴唇不停地打哆嗦，还一个劲地流口水。家人急忙去请医诊治。医生说：“这是中风的症状。”
于是给他开了一些药。但不幸的是，没几天，温峤就去世了，终年四十二岁。江州百姓听到温峤去世的消息，无不相对而泣。晋成帝下诏追赠温峤为侍中、大将军，谥号忠武。