神农表面上是一个医术高明的医生，真实身份却是空忍的首领，企图获得零尾之力从而征服重掌忍界霸权。 而空忍则是一群掌握着凭持铁制羽翼飞行天空的“飞天之术”，并重视于兵器攻击的忍者。 说来这空忍也是奇葩，拥有优秀的飞行能力以及……令人疑惑的空战能力，空忍袭击木叶村可说是大获成功。 通过投掷起爆符炸弹以及苦无机关发射枪，使得整个木叶村陷入混乱之中，就算是纲手看到这些空忍出现后也是……只能站在办公室里面无能狂怒。 然后派出了一组四人小队出战，四个忍者面对好几艘“航空母舰”。 大型水上战斗舰母都出来了，结果离谱的是、航空母舰被油女家的忍者给啃掉了，太过忍者了。 后面还有空中堡垒，空天母舰都出来了，这个忍者村还拥有现代化兵器，如战舰、战机等，总的来说，空忍的战斗力就算换算到地球的二战时代，都可以再赌一次国运。 结果，还是败在油女家的虫子手上，而驱使虫子作家的油女一族，在木叶什么地位啊，只能说忍者简直是科学的天敌。 空忍完全是生错了时代，更是挑错了对手，明知道木叶克服空忍的血脉家族那么多，还要去寻找木叶复仇，这神农也是失了智。 直树不知道神农在那里，但是直树知道，神农的人设是忠厚老实的赤脚老神医，并且还有一个女扮男装的徒弟，阿麻鲁。 而且为了图谋木叶村的八门遁甲之术，在很多年之前，就以一个弱鸡的形象骗过了木叶的审核，成功盗取了村子的八门遁甲。 可见神农并不是一个战斗力强的人，至少，基础能力不强。 不然的话，也不会败在就连仙术都没有的漩涡鸣人手上，那可是让阿凯称皇的八门遁甲啊！ 不过直树还是很馋神农在医疗领域方面的才华的，作为空忍首领，神农还是再生术方面的行家里手。 懂得怎样让忍者的身体获得长生以及强化的秘诀，还拥有着就连大蛇丸都非常渴望的肉体再生和肉体活化能力。 并且神农还懂得如何凝聚邪恶的负面情绪创造人造尾兽，所谓的黑暗查克拉集合体，正是零尾。 这位神农，完全就是个大宝藏啊，所以还等什么，直树已经等不及了。 直树当即召来药师野乃宇，木叶西厂，抄家灭族去了。 而有了直树提供的大概信息，药师野乃宇马上就发现了神农的怪异之处，而拥有神医之名的神农，完全经不起木叶之根的调查。 不到三天，药师野乃宇就从众多的神农“行医”信息中，推断出神农的活路区域以及最有可能的老巢整地带。 空之国，曾经挑衅过木叶村霸主地位，然后在忍界大战之中被消灭的国度。 曾经的空之国，正是神农的主要活动半径。 直树直扑那空忍村的原址，那里才是神农的老巢。 入目所见却是残垣断壁，一片杂草丛生的废墟。 带队的油女取根正是此回的行动主力，被直树特别提拨为此行的负责人。 油女取根报告道：“直树大人，四周都没有发现大规模的群体痕迹。”
直树将目光扫向远方，空忍的大部队，就隐藏在附近的海岛呢。 直树并不准备去找空忍，咱要打草惊蛇，让受惊的空忍主动前来送死。 “各小队做好战斗准备，然后将这片废墟炸上一遍！”
空忍早就发现了直树一行，木叶之根威名赫赫，他们自然敬而远之。 在忍界大战之中被灭国的空忍，尚在偷偷恢复实力之中，战斗水平目前还有限的他们，自然是以苟为上。 然而直树都下令要炸他们空忍的空忍村遗址了，他们那里还忍得住啊。 要知道空忍村地底下，就掩盖着他们空忍村最大的骄傲——可以在空中驰骋作战的吴哥要塞！ 而目前的吴哥要塞尚处于修复阶段，就算想要逃走都飞不起来，而吴哥要塞的内置防御也不曾修复过，就像个不穿衣服的……。 “首领还在阿麻鲁那边养成零尾，我们该怎么办啊科长？”
阿麻鲁即零尾人柱力，无尾之兽，由黑暗查克拉组成，被神农寄放在了阿麻鲁体内，它是依靠人们心中的黑暗而产生的巨大黑暗查克拉之源。 而被称作科长的老科学家很是一脸的绝望，“要塞还缺少由零尾作为动力的动力源。 以及由零尾来填充能源的超级重炮，我们这些科研人员又不精通战斗。 也只能靠牺牲了，消息首领已经收到了吧？”
“已经收到了，首领正带着不成熟的阿麻鲁赶回。”
“那就让护卫舰发动攻击吧，我们必须拖延时间，那怕护卫舰队全军覆没。 只要能够坚持到首领归来，一切都是值得的。”
果然不等杂草丛生的空忍村旧址被覆盖轰炸掀翻，空忍就抛弃了伪装，发动了攻击！ 首先登场的是空袭部队，一连串的翼装空忍超低空飞越根部头顶的同时，投下查克拉炮弹，起爆符机关枪啥的。 如此现代的攻击方式一点也不忍者，可惜根部忍者早就有了防备，而依根部的行动力，就算有倒霉蛋被空忍命中，也可以借用瞬身术逃过一劫。 然后~~就没有了然后，这让准备出手的直树大失所望。 还以为可以看到一场精彩的二战现代VS忍者呢，那知道这些空军仅是一轮游，还没有恢复实力的空忍，有点不够看啊。 “直树大人，已发现空忍的水上舰队，他们正在集结战力。”
油女取根前来指示着。 直树自不可能为了所谓的公平，给空忍集火的机会。 毕竟现在的木叶之根，虽然对外仍是志村团藏的木叶根部，但内部早已是直树的木叶西厂。 除了生不如死、只能被动等候审判日到来的活死人团藏，全都是自家卧底了，直树当然不可能无谓牺牲，“那就趁他病要他命。”
战争过程没啥好说的，主打科学忍具的空忍，根本没有成规模的集团优势，面对全员恶人……全员中忍以上的木叶之根，一旦被近身直接就是被秒杀。 空忍是一面倒的劣势。