许皓在南京掌管朝政以来，朝廷的事务越来越多，越来越杂。原先的六部已经无法胜任应有的作用，所以许皓对六部的职能进行拆解。成立了很多的部门，这些部门都掌管单独的一种事务。比如苏水云掌管的医部，这就是专门管理帝国中的各种医疗事件。……苏水云十分肯定的说道：“没错，我们这次来北京不仅是要解决这次的天花疫情，而且还要将其永远的消除。”
“苏尚书，这真是天佑中华啊。”
黄杨十分兴奋地感叹道。“嗯，在天花爆发后，陛下就传给了我们一种接种方法，这种方法几乎没有不良作用，接种后的人永久地对天花疾病免疫，永不再发。”
“吾皇圣明，天佑中华。”
听到这种方法是皇帝传授的，其他人连忙站起来共同作揖。而后苏水云就对需要和患者接触的官府和军队人员进行牛痘的接种。这也是保证他们在以后的工作中的安全。苏水云他们从南京到北京来的人在出发之前就接种了，现在轻微的反应已经过去。他们已经对天花有了永久的免疫能力。而后苏水云和苏柳就在黄杨以及蒋林飞的带领下前往作为隔离点的村庄。当苏水云等人进入到村庄中时，对村庄中的布置十分欣赏。苏柳感叹道：“黄知府，这隔离村庄你做得很好啊，这既保证了村内人的生活又能极大的减少村外人感染的风险。”
黄杨连忙说道：“苏皇妃谬赞了，此处的布置不是我设立的，而是另有高人。”
“哦，不知是那位高人在此，我一定要见识一番。”
苏水云一听有能人，立刻就来了兴趣。现在他医部正是缺人的时候，如果能够遇到有能力的人，他一定要招揽进医部。黄杨指着不远处走来的一个人说道：“就是他，这里的一切都是这位吴又可大夫。”
苏水云连忙朝吴又可走了过去，和他攀谈了起来。在交谈中两人有一种相见恨晚的感情，双方之间都十分佩服对方的医学造诣。而后苏水云将牛痘接种术传授给了吴又可，后者对于这种方法很是吃惊。苏水云等人来到隔离村后，就没有再离开，一直在村庄中给患者进行接种。对于天花没有十分有效的治疗方法，只能靠自己的免疫能力硬抗。但可以通过接种疫苗的方法，来提高患者对于天花病毒的免疫能力。所以苏水云没有和大部队一起而是提前来的原因就是想要尽早的对患者进行接种。争取减少这次天花疫情的致死率。在将隔离村的患者接种完成后，苏水云和吴又可这对知己就开始了对传染病的研究。毕竟不是什么时候都有这么好的材料给他们研究，而且是不用担心自己的性命的情况下。当苏水云将那套细菌病毒理论讲解给吴又可时，直接让后者有一种醍醐灌顶的感觉。他以前很多想不通的地方，通过这个细菌病毒理论都能够很好的解释。“苏尚书，你真的是天才啊，通过你这套理论，历史上的很多瘟疫都能够得到解释。也为后世的瘟疫防治提供了很好的理论基础。”
吴又可对于苏水云已经有一些崇拜的感觉了，他都有点想要拜师的冲动。对此苏水云连忙制止道：“这些不是我的功劳，这些都是小徒在陛下的指导下完成的，我可不敢抢他们的功劳。”
“你是说，这些都是苏皇妃总结出来的？”
吴又可看着忙碌的苏柳问道。“你这样说也对，说起这个，我带你去看一个神奇的东西。我相信看过之后一定会颠覆你的世界，也能让你对细菌病毒理论有一个更好的理解。”
苏水云突然想到了什么，对吴又可说道。“什么东西？”
苏水云的话一下就提起了这位传染病学家的兴趣。“显微镜。”
……此次来北京，苏水云带来了两台十分精密的显微镜。这是宋应星在了解了透镜原理后运用昂贵材料和复杂工艺做出来的。一共有三台，全在医部。现在带来了两台，为的就是希望通过这次事件对天花进行研究。在通过显微镜观察了很多事物之后，吴又可的内心掀起了滔天巨浪，他完全没想到自己生活的世界居然是这个样子。看完之后吴又可从自己的怀里掏出一本书，上面写着“温疫论”三个字。这是他最近一两年将自己的对抗传染病的经验总结出的一本书，现在了解了这个微生物理论，使得他完全没有继续写下去的动力。看见吴又可手中的书，苏水云拿过来翻看起来。“吴兄，你这本书真是大作啊，这对于以后的瘟疫防治具有很好的指导作用。”
“没用了，通过今天的见识，上面很多的都是错的。”
吴又可有些垂头丧气。毕竟任谁受到这么大的打击都不是一下就能接受的。“吴兄，别丧气。你这本书一定要写出来，现在发现错误改正就好，毕竟我等非圣人，孰能无错。”
在苏水云的鼓励下，吴又可也看开了，现在知道了这么重要的信息，可以更好的完善自己的书籍。这应该是幸事，怎么能沮丧呢，应该高兴才是。……城外对于天花病人的治疗还没有传到城内，毕竟那里已经成为了一个孤岛，只有官府的人员每日往哪里运送物资。这两天刘员外的心情越来越好了，因为已经有人忍不住在他店里购买粮食了。虽然份量很少但这是好的开始，只要北京城的管制继续下去，他的生意一定会越来越好的。以他以前的经验来看，这么大的天花瘟疫再怎么也会持续一两个月的时间。等天花病人都死光了，这北京城才会重新开放。但他不知道的是，现在一辆运满物资的火车正沿着铁路向北京开来，这上面的粮食将让刘员外屯下的粮食血本无归。因为中华帝国可不是大明，她对于疫情的防治能力和决心都是后者能够比拟的。