解决了****，玄烨仍不能稍做休息，因为他还要处理与沙俄的领土争议。玄烨表示，领土争议没有妥协余地，只能霸气到底！公元1686年，康熙二十五年，7月，鉴于入侵者妄自托大，多次警告不听，玄烨派部队围剿雅克萨城。第二次雅克萨之战爆发！黑龙江将军萨布素率2000精兵，分水陆两队向入侵者发起猛攻。与此同时，玄烨再次向沙俄政府郑重提出和平谈判。清军到达雅克萨后，在城外筑建工事，重兵围城，沙俄军队全力突围，被清军一次又一次击溃。清军围攻雅克萨长达两月之久，入侵者内缺粮草，外无援兵，死伤惨重，就连指挥官托尔布津也被清军一击毙命，最后只剩百余残兵犹做困兽之斗。现在，大清掌握了谈判的主动权，但作为胜利方，玄烨仍授意大清谈判代表做出适当让步，不是玄烨忌惮沙俄，而是他要安抚住“北极熊”，以便集中全力收拾准噶尔部的武装叛乱。公元1689年，康熙二十八年，9月7日，清俄双方就和平解决边界问题达成协议，这就是著名的《尼布楚条约》现在，该好好收拾那帮妄图搞国家分裂的人了！清朝时期，蒙古分为漠南蒙古、漠北蒙古和漠西蒙古三个部分，它们先后对清朝表示臣服。准噶尔是漠西蒙古的一个分支，本在伊犁一带过游牧生活，悠然自在，是大清朝的良民。然而自从噶尔丹统治准噶尔部以后，一切都不一样了。噶尔丹是个有野心的家伙，他上位以后，先是杀伐征战，兼并了漠西蒙古的其他部族，随即向东侵犯漠北蒙古。漠北蒙古抵抗不过，几十万人逃到漠南，向清朝政府请求政治庇护。玄烨派自己的使者去见噶尔丹，严令他把侵占的地盘还给漠北蒙古。噶尔丹仗着有沙俄撑腰，态度十分骄横，不但不给玄烨面子，还以追击漠北蒙古为名，大举进犯漠南。给脸不要脸，这是要反天！玄烨决定，必须给他点颜色看看！公元1690年，康熙二十九年，大清分兵两路，向准噶尔部进发：左路由抚远大将军、和硕裕亲王爱新觉罗·福全率领，出古北口；右路由安北大将军、和硕恭亲王爱新觉罗·常宁率领，出喜峰口；玄烨则亲自带兵压后，坐镇指挥。然而，两兵相接的第一场遭遇战，玄烨就尴尬了。当时，常宁的右路军先与噶尔丹军遭遇，随即被对方打了一个漂亮的反击。噶尔丹长驱直入，一直打到离北京只有700里的乌兰布统。噶尔丹还向玄烨示威，那表情，嘚瑟极了！玄烨被撩得心头火起，督促福全全力反击。噶尔丹将几万骑兵部署在大红山下，后有树林掩护，前有河流阻挡。他又将上万头骆驼缚住四脚横放在地，驼背加上箱子，用湿毡裹住，摆成一个长长的驼城。他的军队躲在驼城中间放冷箭暗枪，清军一时逼近不得。福全虎躯一震，怒发冲冠，下令对驼城进行炮火覆盖，一霎时火炮齐响，炮弹如雨，血肉横飞，也不知是人肉，还是驼肉。驼城被生生撕开了一个口子。清军的步兵、骑兵趁机一起杀出，福全又派兵绕到山后夹击，把准噶尔军杀得尸横遍野，侥幸活着的，纷纷弃营奔逃。噶尔丹一看形势不利，派人到清营求和。福全是个实在人，当即停止进攻，向玄烨请示如何处置。玄烨急得直拍脑门子，说哥哥你傻啊，这是缓兵之计，快追，别让这厮跑了！福全连忙领兵去追，噶尔丹果然已经带着残兵逃之夭夭。噶尔丹逃回漠北，表面上向清朝政府表示屈服，暗地里招兵买马，准备东山再起。康熙三十三年（公元1694年），玄烨约谈噶尔丹，想订立个和平相处的盟约。噶尔丹不但不来，还暗中派人到漠南煽动叛乱。他扬言：“准噶尔已经向沙俄大哥借到鸟枪兵6万，玄烨你颤抖了吗？”

玄烨震怒，公元1696年，调集兵马开始第二次亲征。此次征讨，清军兵分三路：黑龙江将军萨布素从东路进兵；大将军费扬古率陕甘大军从西路出兵，截击噶尔丹的后路；康熙亲自带中路军从独石口出发。三路大军约定好，限时对准噶尔形成合围，一起夹攻。玄烨的中路军行进到科图，与敌军前锋遭遇，这时东西两路军还没有到场，又有传言，沙俄将遣兵为噶尔丹助战。有人慌了，说老臣掐指一算，此时不宜恋战，皇上咱们回京吧，风景那边独好。玄烨一听这话，瞬间龙颜大怒，愤愤骂道：“朕堂堂大清天子，见到敌人就撒丫子，传出去让不让人笑话？朕还要脸的吗？！再说，朕中路大军一退，西路大军就会被贼寇打围，朕能丢下自己的兄弟们不管吗？”

玄烨话音一落，大家都觉得，皇上好man啊！当下，玄烨话不多说，继续挥兵挺进，并派使者宣战：朕又亲自来战，你小子这次一定完蛋！噶尔丹闻言突觉心中忐忑，跑上山顶一望，见清军黄旗飘扬，万众待发，吓得连夜拔营奔逃。玄烨掩兵追杀，又令费扬古率西路军在半路上截击。噶尔丹连奔五天五夜，在昭莫多（在今蒙古人民共和国乌兰巴托东南）与费扬古遭遇。昭莫多前为阔地，后有大片密林，自古以来就是打伏击的好地方。费扬古按照玄烨部署，藏军团于密林中，派先锋400人诱战，边战边退，把叛军引入埋伏圈。清军先下马步战，听到号角声起，就一跃上马，占据山顶。准噶尔军向山顶发起冲锋，清军在山顶枪箭齐发，血战异常激烈。费扬古又派人绕到山下，突袭准噶尔军粮草辎重，准噶尔军遭前后夹击，腹背受敌，死伤一片，生者尽降。最后，噶尔丹只带几十余骑逃出生天。经过两次大战，噶尔丹叛乱集团土崩瓦解，玄烨留人一线，再度招降噶尔丹，但噶尔丹仍然继续顽抗。一年后，玄烨又带兵渡过黄河亲征。这时，噶尔丹原来的根据地伊犁已被他侄子霸占，他的左右亲信听说玄烨亲征，纷纷投降。噶尔丹走投无路，服毒自杀。清政府重新控制了阿尔泰山以东的漠北蒙古，给当地蒙古贵族各种封号和官职。清政府又在乌里雅苏台设立将军，统辖漠北蒙古。自此，大清真正进入了王朝阶段。“玄烨”二字从此响彻寰宇，人送外号“千古一帝”！不得不说，玄烨实在是个牛人，不但能文，而且能武，不仅平了三藩，而且收复了台湾，不仅制裁了沙俄侵犯，还御驾亲征噶尔丹。玄烨用自己的行动给他的后人们定下了基调：任何妄图分裂国家的事情，都是绝不允许发生的！只是，他的后代们着实让他大失所望了。