八月十八日，泉州士绅郭显密谋诛杀郑氏余孽，开来凤门，迎大齐王师入城。 守将曾国祚提前侦知，派兵围郭府，将郭显全家一百余口斩尽杀绝。 八月十九日，明军开始在泉州城中大肆搜索细作，屠戮缙绅百姓。 府城血流成河，晋江江口被血水染红。 与此同时，投降齐军的佛朗机人将城中明军兵力、火炮位置告知王增斌。 鉴于曾国祚、朱聿键正在丧心病狂屠城，王增斌果断下令，放弃围城之策，立即强攻。 八月二十日，第七兵团集中所有炮火全力攻打来凤门。 同日，晋江江面的第六舰队舰船，也加入到对来凤门的炮击。 第七兵团总训导官担心火箭和舰炮会对港口造成严重破坏。 毕竟太上皇三令五申，要求务必要保全泉州。 王增斌不以为然道: “太上皇说是让保全泉州百姓，现在百姓受难，怎能坐视不管，港口破坏还能修葺，百姓死了怎么复生。”
二十一日，来凤门上空升起两只热气球，引导海军舰炮轰击明军大营。 明军大溃。 当日，齐军由来风门突入泉州府城，杀曾国栋，擒伪明帝朱聿键，歼灭郑氏余孽。 八月底，泉州境内七县悉数平定。 九月初九日，伪帝朱聿键被押回南京，交由蓑衣卫会同三法司审讯。 九月十五日，伪帝朱聿键以“谋逆、大不敬、僭越、屠城、勾结倭寇”等一八零八道罪行，在紫金山南麓明孝陵（朱元璋马皇后陵）前被凌迟处死。 闽浙经略张允修马不停蹄前往泉州主持清丈亩工作。 谢阳亦派遣商会干吏前往泉州接收郑氏田亩资产、商铺货船，修葺港口。 至于恢复泉州商业秩序，安抚闽商，划分田地，不必再做赘述。 九月初，由商会牵头，朝廷与闽商共同出资，泉州港口清淤一期工程全面开工，一期计划投入三百万两白银，征发民壮十万，修葺港口设施，清理晋江淤泥，逐步恢复泉州港口国际航运。 ~~~~ 九月初，齐军继续西进，追击明军，九月初八日，第六舰队兵不血刃占领厦门。 明军残余势力，伙同盘踞厦门的倭寇海贼，仓皇逃往漳州。 漳州向西进入梅州潮州的通道，早被粤东山贼断绝。 继续向西转进，已是不可能了。 这样一来，漳州就成了东南各路反齐势力最后的大本营。 九月十五日，齐军大军压境，进逼漳州，第六舰队进入厦门外海，封锁明军退路。 同日，王增斌遣使者入府城谈判，要求漳州守军立即弃城投降。 太上皇只诛元凶陈锦，从者全部免死。 陈锦，字律芳，泉州人，幼年家贫，习武有臂力，受海盗郑芝龙接济，天启二年中武举。 弘光八年，为泉州游击，弘光十年，因围剿鞑齐海寇不利，坐免。 弘光十二年，投靠郑森，遂为郑成功心腹。 辽南海战，郑氏败走倭国，陈锦临危受命，留守漳州，组织反抗鞑齐。 陈锦计划“一年准备二年反攻三年扫荡五年成功”。 广德初年，他策划数起对浙江、山东的袭扰活动，“斩鞑虏甚众。”
可惜独木难支，广德三年鞑齐南征以来，明军屡战屡败，一路转进，直至漳州。 半年前，陈锦被隆武帝封为闽浙总督，节制东南军务（准确说是福建三府之地）。 泉州城陷之际，陈锦家眷在泉州被乱兵所杀。 隆武帝被鞑齐凌迟处死。 国仇家恨，容不得这位福建军头投降——在他看来，投降也难逃一死。 议和，当然不是他考虑的问题。 有了萨摩藩大名（其实是一群浪人）的支持，而且幕府大概率也会发兵援助，加上聚集漳州的八千多名残兵，陈锦觉得自己还是有一战之力。 漳州总督府，王增斌亲笔书信被撕成粉碎。 因为暴怒，身材魁梧的陈总督操着一口闽南话骂道： “塞连木！（干你马），首批收跌（滚！）鞑齐想要议和，头壳坏！”
旁边一个身材矮小的倭国武士附和道： “陈总督，江户大将军的援兵，已在路上了，鞑子在泉州杀了那么多日本武士，刘招孙要付出血的代价！”
陈锦点点头，没有再说什么，在他看来，即便倭国不出兵，郑森也会派人回来增援的。 他对面前五花大绑的齐军使者吼道： “把这鞑子腿脚砍了，扔下城去！”
齐军使者面不改色，大笑道： “太上皇怜悯百姓，王将军才让我来劝和，你等不知进退，不知死活，连累漳州百姓，漳州不比泉州，大齐不会投鼠忌器！屠城，在所难免！尔等都要陪葬。”
听到屠城两字，自称萨摩藩使臣的大阪浪人倒吸口凉气，脸色大变。 浪人刚要劝说陈总督几句，却见陈锦猛一挥手： “推下去！砍了！”
当日，第七兵团议和使者被漳州守将五马分尸，尸块扔下城头。 一同被杀的，还有齐国商会在漳州的掌柜伙计二十八人，蓑衣卫眼线七人，漳州城内主张与齐军议和的士绅百姓，三百二十四人。 广德三年九月十六日。 惨烈的漳州围城战正式拉开序幕。 ~~~~~ 如今漳州一带有春节吃春饼、春卷的习俗。 这习俗，和三百多年前一场惨烈的围城之战有着密切联系。 梦吴越先生曾听漳州友人介绍，当年由于王师围城旷日持久（共计四十九日），加之明賊在城中抢夺百姓粮食，造成城中大饥，饿死百姓无数。 尸体相藉，埋葬不及，百姓只得用草席裹尸，委弃路旁。 百姓为纪念这段惨痛历史，以春饼拟作草席裹尸，以示不忘，流传至今。 每到立春，春分，春节，漳州家家户户，男女老少皆聚食春饼、春卷，遂衍为习俗。 谈迁，明末齐初著名史学家，原名以训，字仲木，号射父，浙江海宁人，明亡之后流落福建。 《南游录》为广德年间谈迁在福建亲身经历，具有很高的史料价值。 据《南游录》记载，广德三年，齐军主力兵团海陆并进，在攻取长泰、平和、诏安和南靖等地之后，击败闽浙总督陈锦于江东，遂围逼漳州。 四邻居民入城，各依所亲，以避战乱。 漳州守将杀齐使，坚守不出。 第七兵团尝试几次强攻，发现伤亡过重，遂转为围困。 “聚十三万战兵（十万为明降军），砌筑八十七座木寨，环树二层栅木，外挖两重沟濠，增设火炮三百八十七门，舰船一百零二艘，棋布星列，浑如铁桶，日夜敦促明贼纳降。”
（《南游录》第二卷·第74页） 十月初五日，倭国朱印船五十艘至厦门外海，装载倭兵海贼，援助漳州。 第七舰队佯装撤退，放倭船入九龙江，随即封锁出海口。 初八日，倭船行抵九龙江北港(距漳州府城不足十里），突遭两岸齐军炮兵夹击，满天炮火瞬间摧毁倭船旗舰出云号。 幸存舰船急忙后撤，至江口，又遭受帝国第六舰队截击。 五十艘倭船，两千余倭寇，最后在厦门外海全军覆灭，沉入海底。 漳州本就人多粮少，围城日久，外援断绝，明军搜刮藏粮，不交粮者，皆处死。 十月，城中斗米直五十金。 粮尽，食人炊骨，死者不计其数。 十一月初二日，极度饥饿的守军打开镇远门，向齐军投降。 齐军长驱直入，占据漳州，元凶陈锦举家自焚，倭寇头目井上十一郎被擒，押送南京，等待凌迟。 城中八千明军，战死饿病而死，凡三千人，余者悉数投降大齐。 城中百姓，十余二三，十三万百姓锐减至五万。 历经四十九日的漳州围城，终于结束。 自此，福建归于齐国治下。 附：《南游录》记载： “初，齐军十三万，急攻城，久未克。时，秋汛九江暴涨，齐军筑堤镇门山，激水灌城。城中食尽，人相食，枕藉死者七万。门巷海开，落落如游嘘墓，馋鼠饥乌白昼蹲几上，解围后存者才三四万人。有土人素慷慨，率妻子一恸绝，邻舍窃煮食之，见死者肠中累累皆故纸，字瑞隐然可辩，邻舍亦废箸而绝。”